历史感浓郁的古老街道与现代化气息并存的「神凪市」。 就读于「松涛学园」的主人公“百濑裕一”，是过着平和校园生活的平凡二年级学生。 然而，他安稳的日常却因青梅竹马“八乙女维月”的登场而瓦解。 如同绑架，维月将他带到自己担任部长的「超自然研究会」，简称「超自研」。
该研究会，除主人公外皆为女孩，乍看是个小后宫......但部员却是古流武术宗家的幺女，旧华族的后裔这般个性十足的女生。 除此之外，超自研正试图从研究会升格为社团，故而和执行委员会会长产生对立。 执行委员会提出的社团升格条件是至少4名成员与顾问，以及内容得到委员会认可的活动报告。
为凑齐人数而强制入会的主人公，将面临怎样的命运！？