樱云区坐落于都市近郊，作为赏樱名所而广为人知。 近年来，随着区内再开发计划的推进，创设了导入“学生生活的改善应该由学生自身来完成”的实验性教育制度， 以学生自治为理念的樱云台学院。 在这里，拥有技术与才能的学生要每天勤奋学习，与之成果相应的将获得学习环境改善之类的各种各样的恩惠。 并且，成绩顶尖的人似乎还能够获得一些特权。
——斗转星移，转眼已到春天。 主人公•才城莲，以转入学院我契机久违地回到了樱云区。 为重逢欢欣雀跃的腼腆妹妹、漂亮到几乎让人以为认错人了的青梅竹马。还有仿佛在为重逢庆祝的盛开的樱花树。 然而，仿佛是和这光景作对一般，莲刚一入学就被卷入了学生之间的麻烦当中。 偶然在场的莲帮助了其中的一个女孩子，结果，
「你要不要加入我们部呢？一起以ALIA为目标，改变这个学院吧！」
那个女孩子那么说着，向莲发出了加入自己所属的俱乐部的邀请。
「以ALIA为目标？改变学院？」 莲因为这突如其来的情况而迷惑着，但也因为预感到从此开始的忙乱而快乐的学院生活而雀跃不已。